筛选微生物、研制具有自主知识产权的酶，利用发酵技术、酶技术和食品工程高新技术，以畜禽和水产品下脚料（如畜禽骨、羽、血、内脏、低值鱼、虾蟹壳等）为原料，进行综合开发和利用，变废为宝。

中心通过酶技术对肉鸡加工下脚料、贝类下角料的综合开发和利用技术获国家科技部项目1 项、福建省科技厅重点项目2 项及企业合作项目3 项。国内外核心期刊发表研究论文12 篇，申请国家发明专利6 项，已获授权4 项。科研成果获海峡两岸职工创新成果金奖、全国发明展览会铜奖等奖项。

中心拥有高效降解几丁质、海藻多糖等海洋生物质的保藏菌株，通过低值海洋生物质发酵获得益生元和活菌制剂，用于动、植物生长促进剂，相关研究获福建省科技进步三等奖，并与多个企业进行合作开发。